Les premières traces d'habitat datent du paléolithique. L'ancienne agglomération slave obtint les droits de ville en 1342. Au 15ème siècle Kosice occupa par sa population la troisième place dans la hiérarchie des villes hongroises. Une baisse du commerce résultant du danger constitué par les turcs et les guerres des états mena au 17ème siècle au déclin de la ville. En 1777 l'université fut rénovée et devint l'Académie royale. Le 5 Avril 1945 le Front nationales des Tchèques et des Slovaques y proclama son programme gouvernemental, dont résulta la première constitution tchécoslovaque après 1945.