Aujourd’hui cette église est le siège du Musée de la Slovaquie de l’Ouest.
L’ordre des Clarisses l’a faite construire vers 1239, mais elle n’a été finie que durant la dernière moitié du 13e siècle.

Au 17e siècle, elle n’a pas évité la reconstruction en style baroque ; Les Clarisses de Trnava représentent le premier exemple de l’établissement d’un ordre mendiant connu en Slovaquie et leur église offre une rare occasion de connaître l’architecture des églises de mendiants.
Le maître-autel date de 1721 et les autels latéraux de 1741.
Les bancs en bois placés dans l’oratoire sont remarquables et combinent la division architecturale de l’espace des bonnes soeurs avec du marbre peint.